Um neue Fenster auch bei deaktiviertem Javascript öffnen zu können, wird der Link, der das Popup aufruft, erweitert.
Hier der Quelltext:

function fenster() {
 window.open("../test1.php","Fenster1","width=350, height=300");
}

Und um diese Funktion aufzurufen:

<a href="../Test/test1.php" target="_blank" onClick="javascript:fenster(); return false;">Fenster öffnen</a>

Damit liefert die Javascript-Funktion im Erfolgsfall ein "False" und so wird der normale Linkaufruf nicht ausgeführt.
Ist Javascript dagegen deaktiviert, wird der Link normal im neuen Fenster ("_blank") geöffnet.

Demo: Ein Fenster öffnen

\|/
- -
C(o,o)D
o
---o0o--o0o---